（主流傳媒記者蔡宗憲／台南報導）位於大內的南瀛天文館設備與管理屢遭詬病，包括被投訴商店販賣瑕疵品、觀測館開放使用時間太短、投影螢幕老舊不堪、要民眾自行檢查3D眼鏡是否耐用、沒有停車場、及進場人數沒有控管等問題。
市議員邱莉莉指出，台北市立天文科學館展示館門票40元、劇場館入場門票100元，但台南的南瀛天文館展示館門票就50元、星象館使用3D眼鏡門票為130元，南瀛天文館門票還比台北市立天文館貴，服務品質若較差，自然引起民眾批評。
南瀛天文園區至今已啟用4年，興建投入預算達6億元，其後預算並不充裕，2016年硬體和勞務招標總經費才2千萬元、2017年更只剩9百萬元，南瀛天文館和兒童科學館扣除人事預算，兩館合計年度總預算僅剩4千萬元，行政人員需兩邊跑，業務無法專精，加上資源有限，進而影響服務品質。
邱莉莉表示，許多天文迷期待能呈現專業品質，但教育局每年投入的提升服務品質預算卻連台北市的十分之一都不到，地方政府如真有資源投入的困難，可考慮爭取請中央直接管理引進更多資源，讓政府天文預算的效益更活用。
南瀛天文館表示，相較於國立大型場館，地方博物館在營運上確實遭遇許多挑戰，經費來源更是所有博物館近年來所面臨的共同考驗。南瀛天文館星象劇場是全台灣唯一球幕3D劇場，票價雖比台北天文館略高，仍大幅低於一般電影院，讓民眾以低廉價格體驗3D模擬星空，為解決停車問題，也於道路兩側規畫停車區。
